Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PgrQ00175 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PgrQ00175 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PgrQ00175 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms