Protein–RNA interactions for Protein: P97789

Xrn1, 5'-3' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,719 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn1P97789 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrn1P97789 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xrn1P97789 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms