Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms