Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cry1P97784 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cry1P97784 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cry1P97784 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cry1P97784 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cry1P97784 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms