Protein–RNA interactions for Protein: P97770

Thumpd3, THUMP domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd3P97770 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thumpd3P97770 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms