Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms