Protein–RNA interactions for Protein: P97353

Sec1, Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec1P97353 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec1P97353 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec1P97353 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec1P97353 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec1P97353 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec1P97353 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec1P97353 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec1P97353 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec1P97353 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec1P97353 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec1P97353 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec1P97353 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec1P97353 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms