Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps3aP97351 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rps3aP97351 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rps3aP97351 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rps3aP97351 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rps3aP97351 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rps3aP97351 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rps3aP97351 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3aP97351 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3aP97351 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3aP97351 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3aP97351 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3aP97351 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3aP97351 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3aP97351 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3aP97351 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3aP97351 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3aP97351 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3aP97351 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3aP97351 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3aP97351 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3aP97351 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps3aP97351 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms