Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms