Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms