Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx1P81068 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx1P81068 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Irx1P81068 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms