Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx3P81067 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx3P81067 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx3P81067 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx3P81067 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx3P81067 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx3P81067 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx3P81067 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx3P81067 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms