Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx1P80205 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx1P80205 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx1P80205 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx1P80205 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms