Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1bP70700 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1bP70700 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1bP70700 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1bP70700 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1bP70700 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1bP70700 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1bP70700 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Polr1bP70700 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Polr1bP70700 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1bP70700 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Polr1bP70700 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1bP70700 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1bP70700 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1bP70700 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1bP70700 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1bP70700 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1bP70700 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1bP70700 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1bP70700 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1bP70700 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1bP70700 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1bP70700 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1bP70700 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1bP70700 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1bP70700 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1bP70700 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1bP70700 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Polr1bP70700 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1bP70700 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1bP70700 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1bP70700 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1bP70700 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1bP70700 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Polr1bP70700 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1bP70700 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1bP70700 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1bP70700 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Polr1bP70700 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1bP70700 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1bP70700 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1bP70700 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1bP70700 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1bP70700 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1bP70700 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1bP70700 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1bP70700 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1bP70700 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1bP70700 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1bP70700 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1bP70700 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1bP70700 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Polr1bP70700 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1bP70700 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1bP70700 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1bP70700 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1bP70700 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1bP70700 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1bP70700 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1bP70700 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1bP70700 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1bP70700 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1bP70700 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1bP70700 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms