Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms