Protein–RNA interactions for Protein: P70414

Slc8a1, Sodium/calcium exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a1P70414 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms