Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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