Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SeboxP70368 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SeboxP70368 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeboxP70368 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeboxP70368 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms