Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cux2P70298 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cux2P70298 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cux2P70298 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cux2P70298 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cux2P70298 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cux2P70298 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cux2P70298 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cux2P70298 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cux2P70298 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cux2P70298 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cux2P70298 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cux2P70298 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cux2P70298 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cux2P70298 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cux2P70298 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cux2P70298 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cux2P70298 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cux2P70298 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cux2P70298 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cux2P70298 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cux2P70298 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cux2P70298 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cux2P70298 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cux2P70298 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cux2P70298 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cux2P70298 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cux2P70298 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cux2P70298 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cux2P70298 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cux2P70298 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms