Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf6P70279 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf6P70279 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf6P70279 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf6P70279 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms