Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tuba4aP68368 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tuba4aP68368 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tuba4aP68368 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tuba4aP68368 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tuba4aP68368 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tuba4aP68368 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tuba4aP68368 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tuba4aP68368 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Tuba4aP68368 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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