Protein–RNA interactions for Protein: P63143

Kcnab1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab1P63143 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Kcnab1P63143 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnab1P63143 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnab1P63143 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnab1P63143 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnab1P63143 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnab1P63143 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms