Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms