Protein–RNA interactions for Protein: P62960

Ybx1, Nuclease-sensitive element-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx1P62960 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ybx1P62960 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms