Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps3P62908 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps3P62908 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps3P62908 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps3P62908 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps3P62908 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps3P62908 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps3P62908 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps3P62908 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps3P62908 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps3P62908 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps3P62908 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps3P62908 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms