Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gnb1P62874 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms