Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms