Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms