Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms