Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnnP61807 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnnP61807 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnnP61807 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SnnP61807 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnnP61807 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnnP61807 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SnnP61807 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SnnP61807 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnnP61807 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnnP61807 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SnnP61807 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnnP61807 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnnP61807 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnnP61807 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnnP61807 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnnP61807 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnnP61807 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnnP61807 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnnP61807 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnnP61807 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnnP61807 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnnP61807 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnnP61807 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnnP61807 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnnP61807 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnnP61807 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnnP61807 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnnP61807 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnnP61807 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnnP61807 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnnP61807 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnnP61807 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnnP61807 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnnP61807 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SnnP61807 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnnP61807 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SnnP61807 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnnP61807 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnnP61807 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnnP61807 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnnP61807 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnnP61807 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnnP61807 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnnP61807 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnnP61807 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnnP61807 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnnP61807 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnnP61807 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnnP61807 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnnP61807 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnnP61807 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnnP61807 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnnP61807 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnnP61807 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnnP61807 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnnP61807 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnnP61807 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnnP61807 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnnP61807 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnnP61807 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnnP61807 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnnP61807 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnnP61807 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SnnP61807 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnnP61807 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnnP61807 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnnP61807 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnnP61807 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnnP61807 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnnP61807 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnnP61807 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnnP61807 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnnP61807 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnnP61807 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnnP61807 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnnP61807 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnnP61807 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnnP61807 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnnP61807 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnnP61807 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnnP61807 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnnP61807 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnnP61807 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnnP61807 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SnnP61807 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnnP61807 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnnP61807 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnnP61807 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnnP61807 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnnP61807 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnnP61807 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnnP61807 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnnP61807 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnnP61807 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnnP61807 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnnP61807 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnnP61807 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnnP61807 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnnP61807 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms