Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms