Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3eP60229 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3eP60229 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3eP60229 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3eP60229 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3eP60229 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3eP60229 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3eP60229 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3eP60229 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3eP60229 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3eP60229 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms