Protein–RNA interactions for Protein: P59034

Lrrc3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc3P59034 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc3P59034 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms