Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhbdl3P58873 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms