Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P58686 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P58686 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P58686 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P58686 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P58686 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P58686 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P58686 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P58686 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P58686 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P58686 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P58686 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
P58686 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P58686 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P58686 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P58686 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P58686 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P58686 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P58686 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P58686 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P58686 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P58686 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P58686 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P58686 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P58686 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P58686 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P58686 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P58686 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P58686 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P58686 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P58686 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P58686 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P58686 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P58686 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P58686 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P58686 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P58686 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P58686 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P58686 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P58686 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P58686 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P58686 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P58686 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P58686 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
P58686 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P58686 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P58686 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P58686 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P58686 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P58686 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P58686 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P58686 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P58686 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P58686 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P58686 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
P58686 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P58686 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P58686 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P58686 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P58686 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
P58686 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
P58686 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P58686 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P58686 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P58686 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P58686 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P58686 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P58686 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P58686 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P58686 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P58686 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P58686 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P58686 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P58686 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P58686 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P58686 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P58686 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P58686 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P58686 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P58686 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P58686 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P58686 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P58686 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
P58686 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
P58686 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P58686 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P58686 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P58686 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P58686 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P58686 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P58686 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P58686 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P58686 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P58686 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P58686 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P58686 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P58686 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P58686 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P58686 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P58686 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms