Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bace1P56818 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bace1P56818 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bace1P56818 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bace1P56818 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bace1P56818 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bace1P56818 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bace1P56818 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bace1P56818 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms