Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rp1P56716 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rp1P56716 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rp1P56716 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rp1P56716 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms