Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp5P56399 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp5P56399 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp5P56399 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp5P56399 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp5P56399 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp5P56399 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp5P56399 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp5P56399 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp5P56399 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp5P56399 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms