Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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CartptP56388 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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CartptP56388 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CartptP56388 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CartptP56388 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CartptP56388 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CartptP56388 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CartptP56388 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CartptP56388 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CartptP56388 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CartptP56388 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CartptP56388 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CartptP56388 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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CartptP56388 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CartptP56388 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CartptP56388 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CartptP56388 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CartptP56388 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CartptP56388 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms