Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rrp1P56183 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms