Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NrlP54846 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NrlP54846 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NrlP54846 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NrlP54846 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NrlP54846 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NrlP54846 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NrlP54846 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NrlP54846 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NrlP54846 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NrlP54846 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NrlP54846 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NrlP54846 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NrlP54846 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NrlP54846 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NrlP54846 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NrlP54846 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NrlP54846 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NrlP54846 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NrlP54846 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NrlP54846 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NrlP54846 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NrlP54846 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NrlP54846 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NrlP54846 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NrlP54846 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NrlP54846 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NrlP54846 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NrlP54846 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NrlP54846 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NrlP54846 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NrlP54846 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NrlP54846 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NrlP54846 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NrlP54846 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NrlP54846 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NrlP54846 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NrlP54846 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NrlP54846 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NrlP54846 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NrlP54846 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrlP54846 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NrlP54846 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NrlP54846 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NrlP54846 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NrlP54846 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NrlP54846 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NrlP54846 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NrlP54846 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NrlP54846 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NrlP54846 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NrlP54846 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NrlP54846 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NrlP54846 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NrlP54846 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NrlP54846 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NrlP54846 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NrlP54846 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NrlP54846 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms