Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad23aP54726 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms