Protein–RNA interactions for Protein: P54099

Polg, DNA polymerase subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolgP54099 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolgP54099 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolgP54099 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolgP54099 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PolgP54099 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolgP54099 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolgP54099 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolgP54099 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolgP54099 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolgP54099 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolgP54099 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolgP54099 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolgP54099 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolgP54099 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolgP54099 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolgP54099 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolgP54099 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolgP54099 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolgP54099 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolgP54099 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolgP54099 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolgP54099 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PolgP54099 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolgP54099 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolgP54099 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PolgP54099 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolgP54099 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolgP54099 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PolgP54099 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolgP54099 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolgP54099 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolgP54099 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolgP54099 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolgP54099 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolgP54099 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PolgP54099 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolgP54099 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolgP54099 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolgP54099 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolgP54099 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolgP54099 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolgP54099 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolgP54099 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolgP54099 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolgP54099 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolgP54099 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolgP54099 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolgP54099 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PolgP54099 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolgP54099 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolgP54099 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolgP54099 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolgP54099 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PolgP54099 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolgP54099 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolgP54099 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolgP54099 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolgP54099 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolgP54099 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolgP54099 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolgP54099 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolgP54099 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolgP54099 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PolgP54099 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolgP54099 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolgP54099 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolgP54099 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolgP54099 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolgP54099 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PolgP54099 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolgP54099 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolgP54099 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolgP54099 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolgP54099 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolgP54099 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolgP54099 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PolgP54099 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PolgP54099 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolgP54099 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PolgP54099 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolgP54099 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolgP54099 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolgP54099 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolgP54099 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolgP54099 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolgP54099 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolgP54099 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolgP54099 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolgP54099 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolgP54099 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PolgP54099 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolgP54099 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolgP54099 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolgP54099 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolgP54099 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PolgP54099 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PolgP54099 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolgP54099 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolgP54099 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolgP54099 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms