Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PctpP53808 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PctpP53808 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PctpP53808 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PctpP53808 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PctpP53808 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PctpP53808 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PctpP53808 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PctpP53808 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PctpP53808 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PctpP53808 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PctpP53808 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PctpP53808 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PctpP53808 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PctpP53808 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PctpP53808 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PctpP53808 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PctpP53808 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PctpP53808 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PctpP53808 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PctpP53808 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PctpP53808 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PctpP53808 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PctpP53808 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PctpP53808 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PctpP53808 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PctpP53808 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PctpP53808 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PctpP53808 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PctpP53808 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PctpP53808 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PctpP53808 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PctpP53808 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PctpP53808 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PctpP53808 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PctpP53808 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PctpP53808 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PctpP53808 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PctpP53808 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PctpP53808 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PctpP53808 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PctpP53808 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PctpP53808 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PctpP53808 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PctpP53808 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PctpP53808 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PctpP53808 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PctpP53808 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PctpP53808 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PctpP53808 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PctpP53808 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PctpP53808 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PctpP53808 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PctpP53808 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PctpP53808 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PctpP53808 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PctpP53808 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PctpP53808 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PctpP53808 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PctpP53808 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PctpP53808 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PctpP53808 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PctpP53808 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PctpP53808 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PctpP53808 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PctpP53808 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PctpP53808 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PctpP53808 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PctpP53808 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PctpP53808 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PctpP53808 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PctpP53808 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PctpP53808 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PctpP53808 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PctpP53808 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PctpP53808 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PctpP53808 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PctpP53808 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PctpP53808 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PctpP53808 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PctpP53808 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PctpP53808 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PctpP53808 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PctpP53808 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PctpP53808 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PctpP53808 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PctpP53808 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PctpP53808 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PctpP53808 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PctpP53808 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PctpP53808 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PctpP53808 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PctpP53808 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PctpP53808 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PctpP53808 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PctpP53808 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PctpP53808 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PctpP53808 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PctpP53808 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PctpP53808 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms