Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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