Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Map3k1P53349 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms