Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClgnP52194 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClgnP52194 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClgnP52194 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ClgnP52194 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ClgnP52194 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClgnP52194 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClgnP52194 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClgnP52194 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms