Protein–RNA interactions for Protein: P51678

Ccr3, Probable C-C chemokine receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr3P51678 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccr3P51678 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr3P51678 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr3P51678 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr3P51678 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr3P51678 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr3P51678 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr3P51678 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr3P51678 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr3P51678 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr3P51678 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccr3P51678 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr3P51678 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr3P51678 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr3P51678 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr3P51678 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr3P51678 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr3P51678 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr3P51678 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr3P51678 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr3P51678 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr3P51678 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr3P51678 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr3P51678 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr3P51678 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr3P51678 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr3P51678 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr3P51678 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr3P51678 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr3P51678 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr3P51678 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr3P51678 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr3P51678 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr3P51678 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr3P51678 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr3P51678 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr3P51678 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr3P51678 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr3P51678 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr3P51678 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccr3P51678 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr3P51678 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr3P51678 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr3P51678 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr3P51678 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr3P51678 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr3P51678 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccr3P51678 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms