Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SftpdP50404 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SftpdP50404 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SftpdP50404 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SftpdP50404 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpdP50404 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpdP50404 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpdP50404 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SftpdP50404 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SftpdP50404 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms