Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psen1P49769 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psen1P49769 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psen1P49769 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psen1P49769 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psen1P49769 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psen1P49769 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms